中疾控周刊:北美地区来的电子邮件是怎样造成当地奥密克戎集聚散播的

中疾控周刊:北美地区来的电子邮件是怎样造成当地奥密克戎集聚散播的 中疾控周刊(CDC Weekly)最新一期公布了一起很有可能由北美地区邮递文档造成的新冠奥密克戎突变株北京市集聚散播实例。

中疾控周刊近日发表了《2022年1月北京一起可能由国际邮寄文件引起的新冠Omicron新冠变异毒株传播》。毕业论文公布,1月15日,北京市一名26岁女士(病案A)由于疲惫和发高烧二天,来抗体检测点开展新冠抗体检测,結果呈阳性。本地疾病控制中心接着对该結果做好了核查。除此之外,根据qRT-PCR的迅速位点突变检验表明:该女士传染的新冠病毒带上Q498R基因突变,L452R、T478K缺少和P681R基因突变。这说明该病人感染了新冠病毒Omicron基因变异菌株。

在下面的7日内,病案A的5名密切接触者筛选呈阳性,包含她的妈妈(病案B)、朋友(病案C,也是标示病案)和病例C的三名家庭主要成员(病案D、E和F)。

北京疾控中心随后开展调查以明确感染源。病案A在北方地区某市高等院校汇集地区日常生活和工作中,沒有出门旅游史,都没有与当地或键入的高危对象较深接触。进一步数据调查报告,该病案因作业必须,会经常性收取和发送国际性寄送来的文档。

特别注意的是,该病案于1月11日(病发前2天)收到了一份国际性邮递的文档,该文件于1月7日从国外寄出去,抵达该地后文档的外包装盒开展消毒杀菌。本地疾病预防共收集了1054个自然环境样版,在其中22个样版为该病案接到的国际邮件。

qRT-PCR表明22份样版中有12份SARS-CoV-2的ORF1ab/N基因片段检验呈阳性,在其中2份源自包裝外表层,2份取包装,此外8份源自内部结构文档紙上。除此之外,迅速位点突变测试表明全部12个呈阳性样版都带上Q498R基因突变,说明这也是Omicron基因变异株。

所有6个病案的呼吸系统样版和12个自然环境样版,包含包装和病案A未碰触的含有纸,共搜集到了六个详细的病毒基因组。总而言之,因为病毒载量低,从自然环境样版中得到了1个全基因和1个近总长基因,普及率为88.8%。

转录组测序剖析下结论:全部病毒属于BA.1谱系,即Omicron。除此之外,7个全基因和1个近总长基因共享资源100%的多肽链同质性。进化树分析表明,该病毒感染坐落于2021年12月中下旬在北美洲和东南亚地区收集的一部分菌株簇周边,与同期我国的部分簇存有显着差别。

这也是北京市第一个由Omicron基因变异株引发的当地群集感柒。Omicron基因变异株于2021年11月9日初次报导,并被世卫组织(WHO)列入关心基因变异株(VOC)。截止到2022年2月1日,该组合已在170好几个我国/地域发觉,并已成為全世界关键新冠基因变异菌株。

2022-03-16

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