本次公务员职务与职级套改，与工龄并无关系，无论你工作一年两年，还是十年二十年都不作为套改的参考依据，故你工龄29年首先可以忽略不计副主任科员对应几级主任科员。
套改的重要参考依据是任职级别和年限。根据公务员职务与职级并行规定，本次公务员职级并行的程序是先套改再晋升，首次套改为硬性套改，不考虑职数。套改职级起始的职务任职年限累计计算。
依据上述套改办法，副主任科员12年首次套改四级主任科员，任职时间从12年前任副主任科员时开始计算，即四级主任科员12年。之后在职数允许的情况下，按照每两年一级（二级调研员之后晋升要求3年及以上）条件晋升，那么，12年的副主任科员套改后，理论上（注意：这里是指理论上）可以晋升六次，即直接晋升到二级调研员。实际上，这根本不可能。
各单位按照目前政策首次套改后，无论在哪个层级，基本上会面临一种局面，套改后即满额，或者所剩职数不多，留给晋升的机会并不多。没有职数，套改后无论你任职时间再长都没用，只能等之前占用职数的人退休或调离，空出职数后才有机会获得晋升。就此分析，12年的副主任科员首次套改后，能够获得一到两次的晋升机会就不错了，按照这个概率，至多也就是晋升到二级主任科员，更大概率是只晋升一次，即三级主任科员。
一直从事公务员职级套转和晋升工作，职级的晋升和非领导职务的晋升有很多区别：一是职数核定不一样；二是晋升程序不一样；三是晋升后的待遇不一样。
先梳理一下基本概念：四级主任科员属于职级序列，是综合管理类公务员职级的一个层次，一般是由一级科员晋升而来。副主任科员属于非领导职务序列，是2019年6月《公务员法》修订之前设定的职务之外晋升的一个通道。
我们详细分析一下两者之间的区别和联系：
一、职数核定标准不一样，职级职数普遍比原来非领导职务职数更多。原来的非领导职务，是按照领导职务的职数来核定的，而现在的职级职数，是按照编制数量来核定的。假设一个市直单位，编制50人，科级领导职数18个，则主任科员和副主任科员职数是领导职数的二分之一，也就是9个。主任科员职级职数则是编制数的60%，是25个。可以看出，职级实施后，职数是比非领导职务的职数增加了的。
二、晋升程序不一样，职级程序更为简化。非领导职务晋升，一般是按照领导职务晋升的程序去做的，比较麻烦，也比较严谨。职级实施后，国家对于职级的晋升程序要求是简化的，三四级主任科员甚至不需要进行组织考察，只需要结合日常表现进行确定就可以。
三、晋升后待遇不一样。非领导职务晋升后，所享受到的经济待遇和副科实职基本相当，略低但是低的有限，而且副主任科员下一步符合条件可以直接晋升正科级领导干部或者主任科员，可以转任副科实职。
四级主任科员待遇低于副科实职，和副主任科员基本相当，下一步可以晋升三级主任科员或者正科实职，也可以转任副科实职。和副主任科员最大的区别是四级主任科员不能晋升主任科员对应的二级主任科员，只能先晋升三级主任科员才有资格。比较原来的非领导职务，其实速度是放慢了的。
这就是我了解到职级和非领导职务之间的区别和联系，希望对你有所帮助。
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92年的主任科员和2006年后的主任科员有联系有区别，总体来说92年的主任科员含金量更大。
讨论此问题，要分两个时间段来分析。
92年至2019年以前的非领导职务区别主任科员是2019年新公务员法实施前的非领导职务，对应正科级领导职务。2019年6月公务员职务与职级并行后，非领导全部取消改由职级替代，原来的非领导职务变成职级后又是另外一个概念，第二阶段我们再讨论，先看92年至2019年6月以前这段时间主任科员的区别。
在92年到2019年这段时间有个时间点，即2006年，这一年公务员法正式颁布实施，意味着公务员职务管理更加规范化，由此对公务员职务提升的影响非常大。在此之前，公务员的领导职务和非领导职务提拔相对随意，但职数、名额比较少，2006年之后提拔规范了，难度虽然看起来有所增加，但职数总体增多了，实际上提拔比以前更为容易。职数的增多，意味着价值的降低，因此公务员法实施后，不管领导职务还是非领导职务的含金量比以前都降低了。这是其一。
另一方面，在2006年公务员法实施之前，干部的选拔任用相对不规范，因此经常可以出现现在不常见的超常规提拔，比如跳级提拔。特别是上世纪90年代，因为干部“四化”需要，各地各级都在大面积更新干部年龄结构、知识结构和专业结构，使得很多有知识有技术年轻的干部脱颖而出，经常有非领导职务直接一步到位提拔到上一级领导职务甚至越级提拔的情况，比如主任科员直接提拔为副处长甚至处长，而在2006年公务员法实施后，这几乎是不可能发生的事情。这从侧面客观反映了92年的科员要比2006年的科员“值钱”得多。为什么老一辈的领导总是感叹现在的干部级别上得快、领导干部多很大一部分原因即在此。
2019年前后的非领导职务和职级区别总体来看，2006年前的非领导职务要比2006年后到2019年这段的非领导职务含金量高。而当2019年公务员职级替代非领导职务后，职级的含金量比非领导职务又降低了一个档次。
以前的非领导职务提拔晋升相对较难，对任职年限要求也比较高，比如由副主任科员晋升主任科员，一般要求在副主任科员岗位上任满四年以上，而副科的四级主任科员要晋升到正科的二级主任科员虽然也是要求四年到其中间隔着一个三级主任科员，两年就可以晋升提高待遇，中间的间隔不像非领导职务之间晋升那么漫长，客观上等于降低了难度。除此之外，非领导职务在其他很多方面的待遇都要高于职级，比如工资待遇，非领导职务虽然不能享受领导职务津贴，可除此之外领导职务该有的非领导职务都有，而同级的职级公务员只是享受工资待遇；比如工作待遇，以前非领导职务可以享受领导职务同等的办公用房、阅文等待遇，根据工作需要一般都会给予分工，由其负责或分管一块工作，明面上是非领导实际上仍享受着领导待遇，谁也不敢小瞧，而现在的职级公务员主要体现在员上，与领导职务待遇天差地别，远不能比以前的非领导职务。
